หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. สำนักส่งเสริมวิชาการและงานทะเบียน
2. สำนักบัณฑิตศึกษา
3. สำนักสหกิจศึกษา
4. สำนักพัฒนาคุณภาพการศึกษาเพื่อความเป็นเลิศ
5. โรงเรียนสาธิตนวัตกรรม มทร.ธัญบุรี

หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. กองนโยบายและแผน
2. กองยุทธศาสตร์ต่างประเทศ

หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. สำนักงานสภามหาวิทยาลัย
2. สำนักวิทยบริการและเทคโนโลยีสารสนเทศ

หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. สำนักจัดการทรัพย์สิน
2. ศูนย์ความเป็นเลิศ (COE)
3. กองประชาสัมพันธ์
4. สถานีวิทยุกระจายเสียง มทร.ธัญบุรี
5. หอพักนักศึกษา

หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. กองอาคารสถานที่
2. วิทยาเขตและศูนย์

หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. กองคลัง
2. กองบริหารงานบุคคล

หน่วยงานภายใต้การกำกับดูแล
1. สถาบันวิจัยและพัฒนา
2. สำนักงานบริการวิชาการ
3. หน่วยบ่มเพาะวิสาหกิจ
4. สำนักความร่วมมืออุตสาหกรรม 

งานภายใต้การกำกับดูแล
สถาบันวิจัยและพัฒนา
1. งานด้านยุทธศาสตร์ แผนงานและงบประมาณ
2 .งานด้านอุตสาหกรรมสัมพันธ์
3. งานโครงการจัดตั้งวิทยาลัยนานาชาติ
4. งานสถาบันจิงซื่อ

งานภายใต้การกำกับดูแล
1. งานด้านการกีฬาและสุขภาพ
2. งานบริหารจัดการพื้นที่ศูนย์รังสิตและคลองสามวา
3. งานยกระดับความร่วมมือกิจกรรมจิตอาสา
4. งานด้านการป้องกันปัญหายาเสพติด ในส่วนของบุคลากรและนักศึกษาของมหาวิทยาลัย
5. งานจัดการสนามกีฬาและสิ่งอำนวยความสะดวกด้านการพัฒนาศักยภาพนักศึกษาของมหาวิทยาลัย

งานภายใต้การกำกับดูแล
1. งานด้านพัฒนานักศึกษานานาชาติ
2. งานด้านยุทธศาสตร์และความร่วมมือต่างประเทศ
3. งานด้านพันธกิจสัมพันธ์ทั้งภายในและภายนอกของมหาวิทยาลัย
4. งานด้านการประชาสัมพันธ์

งานภายใต้การกำกับดูแล
สำนักงานอธิการบดี
1. งานด้านสภามหาวิทยาลัย
2. งานด้านต่าง ๆ ที่สำนักงานอธิการบดีรับผิดชอบ
3. งานด้านกิจการพิเศษของมหาวิทยาลัย

งานภายใต้การกำกับดูแล
สำนักพัฒนาคุณภาพการศึกษาเพื่อความเป็นเลิศ
1. งานด้านนวัตกรรมการเรียนการสอน
2. งานด้านการยกระดับมหาวิทยาลัยสู่มตราฐานสากล
3. งานด้านการพัฒนาอาจารย์ด้านการเรียนการสอนมืออาชีพ (PSF)

งานภายใต้การกำกับดูแล
1. งานด้านต่าง ๆ ที่กองกลางรับผิดชอบ
2. งานพระราชทานปริญญาบัตรและงานพระราชพิธีต่าง ๆ
3. งานด้านประเมินคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงานภาครัฐ (ITA)
4. การขับเคลื่อนพิพิธภัณฑ์บัว
5. การพัฒนาแหล่งเรียนรู้และการใช้ประโยชน์ในพื้นที่ศูนย์ปราจีนบุรี
6. งานการวางโครงสร้างพื้นฐานภายในมหาวิทยาลัยพื้นที่ศูนย์ปราจีนบุรี

งานภายใต้การกำกับดูแล
1. งานด้านการพัฒนาบัณฑิตศึกษา
2. งานด้านการใช้พลังงาน และการประหยัดพลังงานในมหาวิทยาลัยเพื่อความยั่งยืน
3. งานด้านพันธกิจสัมพันธ์ของมหาวิทยาลัย

งานภายใต้การกำกับดูแล
1. งานพัฒนานักศึกษาและศิษย์เก่าสัมพันธ์
2. งานด้านความร่วมมือเกี่ยวกับอาชีวศึกษาทั้งในและต่างประเทศ
3. งานยุทธศาสตร์ด้านงานยานยนต์ไฟฟ้าและเทคโนโลยีสารกึ่งตัวนำ
4. งานรองอธิการบดีที่กำกับดูแลด้านการใช้ประโยชน์พื้นที่